Identification of MEG8/miR‐378d/SOBP axis as a novel regulatory network and associated with immune infiltrates in ovarian carcinoma by integrated bioinformatics analysis

نویسندگان

چکیده

Background To investigate the potential molecular mechanism of ovarian cancer (OC) evolution and immunological correlation using integrated bioinformatics analysis. Methods Data from Gene Expression Omnibus was used to gain differentially expressed genes (DEGs). Ontology Kyoto Encyclopedia Genome pathway analysis were completed by utilizing Database for Annotation, Visualization, Integrated Discovery. After multiple validations via The Cancer Atlas (TCGA), Genotype-Tissue (GTEx) projects, Human Protein Atlas, Kaplan–Meier (KM) plotter, immune logical relationships key gene SOBP evaluated based on Tumor Immune Estimation Resource, Set Enrichment Analysis (GSEA) software. Finally, lncRNAs-miRNAs-mRNAs subnetwork predicted starBase, TargetScan, miRBD, LncBase, individually. Correlation expression prognosis mRNAs, miRNAs, lncRNAs confirmed TCGA, Profiling Interactive 2 (GEPIA 2), KM. Results A total 192 shared DEGs discovered four data sets, including 125 upregulated 67 downregulated genes. Functional enrichment presented that they mainly enriched in cartilage development, PI3 K-Akt signaling pathway. Lower independent prognostic factor inferior OC patients. downregulation enhanced infiltration levels B cells, CD8+ T Macrophage, Neutrophil, Dendritic cells. GSEA also disclosed low showed a significantly associated with activation various immune-related pathways. we first reported MEG8/miR-378d/SOBP axis linked development through regulating cytokines Conclusions Our study establishes novel OC, triple probably affects progression

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

analysis of power in the network society

اندیشمندان و صاحب نظران علوم اجتماعی بر این باورند که مرحله تازه ای در تاریخ جوامع بشری اغاز شده است. ویژگیهای این جامعه نو را می توان پدیده هایی از جمله اقتصاد اطلاعاتی جهانی ، هندسه متغیر شبکه ای، فرهنگ مجاز واقعی ، توسعه حیرت انگیز فناوری های دیجیتال، خدمات پیوسته و نیز فشردگی زمان و مکان برشمرد. از سوی دیگر قدرت به عنوان موضوع اصلی علم سیاست جایگاه مهمی در روابط انسانی دارد، قدرت و بازتولید...

15 صفحه اول

Identification of differentially expressed genes and signaling pathways in ovarian cancer by integrated bioinformatics analysis

Background The mortality rate associated with ovarian cancer ranks the highest among gynecological malignancies. However, the cause and underlying molecular events of ovarian cancer are not clear. Here, we applied integrated bioinformatics to identify key pathogenic genes involved in ovarian cancer and reveal potential molecular mechanisms. Results The expression profiles of GDS3592, GSE54388...

متن کامل

a contrastive analysis of concord and head parameter in english and azerbaijani

این پایان نامه به بررسی و مقایسه دو موضوع مطابقه میان فعل و فاعل (از نظر شخص و مشار) و هسته عبارت در دو زبان انگلیسی و آذربایجانی می پردازد. اول رابطه دستوری مطابقه مورد بررسی قرار می گیرد. مطابقه به این معناست که فعل مفرد به همراه فاعل مفرد و فعل جمع به همراه فاعل جمع می آید. در انگلیسی تمام افعال، بجز فعل بودن (to be) از نظر شمار با فاعلشان فقط در سوم شخص مفرد و در زمان حال مطابقت نشان میدهند...

15 صفحه اول

Bioinformatics identification of miRNA-mRNA regulatory network contributing to lung cancer invasion

Background: Over the past 15 years, significant insights have been gained into the roles of miRNAs in cancer. In various cancers, miRNAs can act as oncogenes, tumor suppressors, or control the metastasis process by modulating the expression of numerous target genes. This study is aimed at determining molecular network of miRNA-mRNA regulating lung cancer invasion, by bioinformatics approaches. ...

متن کامل

Bioinformatics Identification of miRNA-mRNA Regulatory Network Contributing Primary Lung Cancer

Introduction: In clinical practice, distinguishing invasive lung tumors from primary tumors remains a challenge. With recent advances in understanding biological alterations of tumorigenesis and molecular analytic technologies, using these molecular alterations can be sensitive and tumor-specific as biomarker for the stratification of patients. In this study, the molecular network of miRNA-mRNA...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Cancer Medicine

سال: 2021

ISSN: ['2045-7634']

DOI: https://doi.org/10.1002/cam4.3854